Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF8Q5VWM4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms