Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCID2Q5JVF3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms