Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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