Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ACKR1Q16570 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms