Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NTRK3Q16288 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NTRK3Q16288 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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