Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPS72Q15906 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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VPS72Q15906 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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VPS72Q15906 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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