Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ITSN1Q15811 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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