Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CDSNQ15517 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CDSNQ15517 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CDSNQ15517 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CDSNQ15517 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CDSNQ15517 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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CDSNQ15517 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CDSNQ15517 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CDSNQ15517 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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