Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PUM3Q15397 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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PUM3Q15397 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PUM3Q15397 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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PUM3Q15397 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PUM3Q15397 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PUM3Q15397 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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