Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAM2Q15035 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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