Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
R3HDM1Q15032 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms