Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IHHQ14623 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms