Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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