Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

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Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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ITGA7Q13683 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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ITGA7Q13683 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA7Q13683 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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