Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
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FOXE3Q13461 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
FOXE3Q13461 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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