Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SCGB2A2Q13296 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SCGB2A2Q13296 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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