Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPS1Q13098 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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