Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GRIN2AQ12879 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GRIN2AQ12879 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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