Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TGM3Q08188 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms