Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SRSF4Q08170 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms