Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHRNDQ07001 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNDQ07001 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms