Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PAX8Q06710 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PAX8Q06710 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms