Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TYRO3Q06418 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms