Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms