Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBXN1Q04323 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms