Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IFITM3Q01628 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IFITM3Q01628 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms