Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK16Q00536 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms