Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX1P83916 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX1P83916 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CBX1P83916 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms