Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITX1P78337 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms