Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SKP1P63208 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SKP1P63208 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms