Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERVK_113P63132 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms