Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HERVK_113P62684 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HERVK_113P62684 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms