Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UFM1P61960 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms