Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ACTBP60709 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ACTBP60709 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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