Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVFC1P60507 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms