Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EDDM3BP56851 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EDDM3BP56851 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms