Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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