Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HK3P52790 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HK3P52790 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HK3P52790 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HK3P52790 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms