Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PGDP52209 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PGDP52209 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PGDP52209 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PGDP52209 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms