Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMARCA2P51531 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms