Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP4P49662 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP4P49662 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms