Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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TTPAP49638 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TTPAP49638 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TTPAP49638 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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TTPAP49638 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TTPAP49638 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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