Protein–RNA interactions for Protein: P49459

UBE2A, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2AP49459 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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UBE2AP49459 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
UBE2AP49459 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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