Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLCP48506 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCLCP48506 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GCLCP48506 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCLCP48506 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms