Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ME1P48163 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ME1P48163 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ME1P48163 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms