Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZEB1P37275 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms