Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LTBRP36941 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms