Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CHRNA3P32297 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms