Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC8P31273 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms