Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCAP28676 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GCAP28676 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GCAP28676 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GCAP28676 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms